پژوهشگاه در قالب سه پژوهشکده و یک مرکز تحقیقات و 23 عضو هیأت علمی تمام وقت، مجتمع عظیم 10 هزار هکتاری آموزشی– پژوهشی بقیه ا… الاعظم (عج) (چاه نیمه) و مجموعه آزمایشگاه ها از بهمن 1400 با مستقل شدن از دانشگاه زابل، فعالیت خود را در منطقه سیستان آغاز نمود.